كتابخانه دانشكده پزشكي شامل بخش هاي زير مي باشد:

بخش امانت
رشد و بالندگي هر كتابخانه به ارائه خدمات مستمر، مناسب و روزآمد بستگي دارد، بنابراين جايگاه هر كتابخانه را كميت و كيفيت خدمات و نحوه ارائه آن به جامعه استفاده كننده، مشخص مي سازد.
در زمينه جايگاه و اهميت بخش امانت نيز كافيست بدانيم كه  نمود عيني و عملي تمامي فعاليتها و تلاشهاي صورت گرفته در ساير بخشهاي كتابخانه در بخش امانت كتاب متبلور و عيان مي شود.
سيستم امانت كتابخانه با استفاده از نرم افزار فرا كاوش انجام مي گردد.

اهم فعاليت  كتابداران بخش امانت :
* امانت وبازگشت كتاب از كاربران وفايل كتابهاي برگشتي درقفسه ها
* قفسه آرائي كتب بصورت هفتگي
* پاسخ گويي به مراجعان و تمديد و رزرو كتب در خواستي درموارد ضروري
* وجين كتب پاره و از رده خارج شده و ارسال به بخش فهرست نويسي
* تفكيك كتب پاره جهت صحافي و فايل آنها درقفسه پس از بازگشت از صحافي
* راهنمائي و مشاوره به استفاده كنندگان ومراجعين به كتابخانه
 * راهنمائي به بازديدكنندگان و تورهاي بازديد ازكتابخانه
* اعلام نيازهاي سالن مخزن به مسئول بخش
* تسويه حساب اعضاء كتابخانه
* دريافت جريمه براي تاخير كتاب

بخش مرجع
هدف هر كتابخانه اي، گردآوري، سازماندهي منابع و ارائه خدمات به كاربران است. بخش عمده اي از اين خدمات به عهده بخش مرجع مي باشد. لغت مرجع را "آنچه در امور به آن رجوع ميكنند " تعريف نموده اند اين رجوع تنها به منابع چاپي محدود نميشود بلكه هر چيزي كه بوسيله آن بتوان براي سوال خويش و ديگران پاسخ درستي يافت در حكم منابع مرجعند .
اين بخش ارتباط دهنده سه ضلع مثلث بين كتابدار، مراجعين و منابع و وظيفه پاسخگويي و راهنمايي مراجعين را دارد و سيستم امانت اين بخش كتابخانه با استفاده از نرم افزار فرا كاوش  انجام مي گردد.
از خصوصيات بارز آن ميتوان به موارد زير اشاره گردد:
* منابع مرجع هرگز به قصد آن نگارش نشده كه از اول تا آخر خوانده شود، مانند واژه نامه ها، دائره المعارفها
* اين منابع معمولاً‌ به امانت داده نمي شود و فقط در سالن و يا تالار كتابخانه قابل استفاده است. البته منابع آن به صورت كوتاه مدت با صلاحديد كتابدار بخش مرجع امانت داده مي شود.
* عمدتاً‌ جهت دستيابي سريع به اطلاعات خويش داراي نظم خاص و سيستماتيك ميباشند.

منابع بخش مرجع شامل:
* كتابهاي مرجع (اطلسها، دايره المعارفها، راهنماها و فرهنگ هاي لغت)
* لوح هاي فشرده فارسي و لاتين
* سالن مطالعه ويژه منابع بخش مرجع
*  پايان نامه ها

بخش فني:
اين بخش شامل قسمتهاي زير و از بخش هاي اصلي يك كتابخانه تخصصي بحساب مي آيد:
فهرستنويسي، آماده سازي  ، ثبت  و سفارشات

    فهرستنويسي
فهرست‌نويسي به فرآيندي گفته مي‌شود كه براي آماده‌سازي يك كتاب، يا يك مجموعه مكتوب، يا چندرسانه‌اي انجام مي‌شود تا دستيابي سريع و صحيح به آن كتاب يا مجموعه ميسر شود.هدف اصلي فهرست‌نويسي، برقراري نظمي است كه به كمك آن هم كتابدار و هم مراجعه كننده بتوانند به سهولت و صحت، كتاب مورد نياز خود را از ميان كتابهاي موجود در كتابخانه بيابند.
 
    آماده سازي
هدف از اين بخش آماده كردن منابع از طريق گرفتن خروجي (ليبل و باركد) جهت بازيابي سريع وآسان و قرار دادن آن در قفسه هاي مربوطه براساس رده منبع مي باشد . آماده سازي كتب از طريق گرفتن خروجي كامپيوتري كه شامل تهيه باركد وليبل وچسباندن برروي عطف كتاب با فاصله هايي خاص و زدن چسب نواري پهن برروي آن مي باشد.
پيگيري و رفع اشكال درارتباط با تهيه خروجي شماره ثبت ورده كتاب از طريق تماس با واحد فهرستنويسي و امانت انجام مي گيرد.

    ثبت
تمامي منابع در كتابخانه دانشكده پزشكي  ثبت و فهرست مي گردد.
   
    سفارشات
براي تجهيز هركتابخانه ابتدا بايد مطابق با نياز مراجعه كنندگان آن منابع را تهيه نمود و با شناخت كامل به جامعه استفاده كننده بهتر مي توان اين كار را انجام داد و در واقع جزء كارهاي يك كارشناس متخصص به حساب مي آيد.
مسئول سفارشات اين كتابخانه هنگام خريد منابع از نمايشگاه ها بصورت مستقيم و حضوري با مديران گروه هاي آموزشي دانشگاه به منظور خريد بهترين منابع در ارتباط مي باشد و خريد منابع براي تمامي كتابخانه هاي دانشگاه بصورت مستقل انجام مي گيرد.